微生物肥料菌种激发植物免疫防卫并适应活性氧爆发的机制（中国农业科学院供图）
据介绍，根际微生物是植物的第二基因组，对植物的生长和健康具有重要作用，其中具有根际益生功能的芽孢杆菌是微生物肥料的主要生产菌种，是支撑农业绿色发展的重要投入品。微生物在植物根表的高效定殖是发挥有益功能的前提，很多微生物肥料的田间效果不稳定就是由于其定殖效率较低导致，而这些微生物如何应对植物免疫实现高效定殖是解决其定殖不稳定的关键科学问题。
植物能够识别细菌的保守分子并产生基础免疫，并伴随着活性氧的爆发，从而抵抗微生物的定殖。研究发现芽孢杆菌和它的鞭毛多肽（flg22）能够引起根系的活性氧爆发，然而活体的病原菌由于对植物免疫的抑制和逃逸策略，并未激发植物的活性氧爆发。研究发现益芽孢杆菌却能够比病原菌耐受数倍浓度的活性氧。该研究证明芽孢杆菌的一类保守的双组分调控系统ResDE参与了对活性氧的耐受并促进了芽孢杆菌的根际定殖。